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Le Centre Æquatoria était un centre de recherches spécialisé dans l'étude des langues, des cultures et de l'histoire (précoloniale et coloniale) de l'Afrique sub-saharienne. Il regroupait une bibliothèque, des archives et une guesthouse. Il était localisé sur le domaine de la mission catholique (Missionnaires du Sacré-Coeur) à Bamanya, un village rural à 10 km de Mbandaka, à l'ouest de la République Démocratique du Congo. 

Le directeur du Centre Æquatoria était Honoré Vinck et son bibliothécaire et documentaliste/archiviste Guillaume I. Essalo.

Le dernier comité scientifique de la revue arrêtée "Annales Æquatoria" était composé de:

L'histoire du Centre Æquatoria commença en 1980, mais ses origines remontent à 1937. En cette année, Edmond Boelaert (1899-1966) et Gustaaf Hulstaert (1900-1990), deux missionnaires belges MSC, fondèrent le périodique africaniste "Æquatoria", dédié à l'étude des langues et de la culture des peuples de la cuvette centrale du fleuve Congo, principalement les Mongo. "Æquatoria" se mêla aussi aux débats sur les méthodes de colonisation, principalement dans les domaines de la justice et de l'enseignement. En 1980, André Claessens et Honoré Vinck relancèrent la revue sous forme d'une édition annuelle "Annales Æquatoria". Dans ce contexte, ils réunirent la documentation, livres, cartes géographiques et autres matériaux que les fondateurs avaient accumulés pendant 50 ans et les réorganisèrent. Depuis 1987 ce patrimoine culturel fut abrité dans de nouveaux locaux, accessibles au public, et fut appelé: "Centre Æquatoria".

La bibliothèque du Centre Æquatoria disposait d'une collection de monographies et périodiques, comprenant plusieurs titres anciens et rares, relevant des domaines africanistes mentionnés plus haut. La bibliothèque contenait environ 8 000 livres en langues européennes, ainsi que des séries complètes d'importantes collections africanistes. Elle comprenait également 252 périodiques arrêtés (environ 3 500 volumes), et 60 périodiques courants. On y trouvait une collection unique de publications en langues africaines, parfois très difficiles à localiser dans d'autres bibliothèques à travers le monde. Elle était le résultat de l'esprit de collectionneur qu'était Gustaaf Hulstaert, recherchant activement toute publication en langues africaines (livrets d'écoles, livrets religieux, périodiques locaux).

Jusqu'en 1998 le Centre Æquatoria organisait régulièrement des événements scientifiques, comme des ateliers, des colloques, des "weekends scientifiques", des écoles d'été et autres, invitant des chercheurs d'universités congolaises et de l'extérieur à se pencher sur des thèmes africanistes.

Le Centre Æquatoria disposait d'une guesthouse à l'usage des chercheurs du Congo et de l'extérieur souhaitant travailler dans la bibliothèque et/ou les archives ou prévoyant des recherches sur le terrain dans la région. En période de stabilité, Bamanya offrait une ambiance rurale agréable et était un endroit idéal pour l'étude et la réflexion.